Molekulare Mechanismen bei malignen Lymphomen

Das Verbundprojekt "Molekulare Mechanismen bei malignen Lymphomen", das von der Deutschen Krebshilfe gefördert wird, beschäftigt sich mit tumorbedingten Veränderungen des Genoms und der Genexpression sowie deren Beziehung zu klinischen Daten wie Therapieansprechen und Überlebenszeit der Patienten mit aggressiven Lymphomen. Das IMISE übernimmt in diesem Verbund die Aufgaben Biometrie, Bioinformatik und Dokumentationszentrale.

Weitere Informationen können der offiziellen Homepage des Verbundprojektes entnommen werden.

Ansprechpartner

Mitarbeiter

• Prof. Dr. Markus Löffler (Projektleiter)
• Markus Kreuz (Biostatistiker)
• Dr. Dirk Hasenclever (Biostatistiker)
• Dr. Maciej Rosolowski (Biostatistiker)
• Jens Gietzelt (Biostatistiker)
• Jan Schäfer (Datenbanken)
• Ulrike Schoenwiese-Thiele (Datenmanagement)

Kooperationen

• Prof. Dr. Erhardt Rahm (GeWare-Administration und Implementation)
  Abteilung Datenbanken des Instituts für Informatik
• Toralf Kirsten (GeWare-Administration und Implementation)
  Interdisziplinäres Zentrum für Bioinformatik

Status

Aktuell befindet sich das Projekt in der zweiten Förderperiode (10/2006-09/2009).

Meilenstein 1 (abgeschlossen):

Erstellung des Studienprotokolls inklusive Dokumentationskonzept, Benutzer- und Sicherheitskonzept, Festlegung des Material- und Datenflusses.

Meilenstein 2 (erreicht):

Implementation der Verbunddatenbank, Testung und Freigabe

Meilenstein 3 (in Arbeit):

Auswertung der im Verbund erhobenen Daten

Publikationen

• Hummel M, Bentink S, Berger H, Klapper W, Wessendorf S, Barth TF, Bernd HW, Cogliatti SB, Dierlamm J, Feller AC, Hansmann ML, Haralambieva E, Harder L, Hasenclever D, Kuhn M, Lenze D, Lichter P, Martin-Subero JI, Moller P, Muller-Hermelink HK, Ott G, Parwaresch RM, Pott C, Rosenwald A, Rosolowski M, Schwaenen C, Sturzenhofecker B, Szczepanowski M, Trautmann H, Wacker HH, Spang R, Loeffler M, Trumper L, Stein H, Siebert R

  A biologic definition of Burkitt's lymphoma from transcriptional and genomic profiling

  N Engl J Med. 2006 Jun 8;354(23):2419-30
• Kreuz M, Rosolowski M, Berger H, Schwaenen C, Wessendorf S, Loeffler M, Hasenclever D.

  Development and implementation of an analysis tool for array-based comparative genomic hybridization.

  Methods Inf Med. 2007;46(5):608-13.
• Dierlamm J, Murga Penas EM, Bentink S, Wessendorf S, Berger H, Hummel M, Klapper W, Lenze D, Rosenwald A, Haralambieva E, Ott G, Cogliatti SB, Möller P, Schwaenen C, Stein H, Löffler M, Spang R, Trümper L, Siebert R; Deutsche Krebshilfe Network Project "Molecular Mechanisms in Malignant Lymphomas".

  Gain of chromosome region 18q21 including the MALT1 gene is associated with the activated B-cell-like gene expression subtype and increased BCL2 gene dosage and protein expression in diffuse large B-cell lymphoma.

  Haematologica. 2008 May;93(5):688-96. Epub 2008 Mar 26.
• Klapper W, Szczepanowski M, Burkhardt B, Berger H, Rosolowski M, Bentink S, Schwaenen C, Wessendorf S, Spang R, Mller P, Hansmann ML, Bernd HW, Ott G, Hummel M, Stein H, Loeffler M, Trümper L, Zimmermann M, Reiter A, Siebert R; Molecular Mechanisms in Malignant Lymphomas Network Project of the Deutsche Krebshilfe.

  Molecular profiling of pediatric mature B-cell lymphoma treated in population-based prospective clinical trials.

  Blood. 2008 Aug 15;112(4):1374-81. Epub 2008 May 28.
• Bentink S, Wessendorf S, Schwaenen C, Rosolowski M, Klapper W, Rosenwald A, Ott G, Banham AH, Berger H, Feller AC, Hansmann ML, Hasenclever D, Hummel M, Lenze D, Müller P, Stuerzenhofecker B, Loeffler M, Truemper L, Stein H, Siebert R, Spang R; Molecular Mechanisms in Malignant Lymphomas Network Project of the.

  Pathway activation patterns in diffuse large B-cell lymphomas.

  Leukemia. 2008 Sep;22(9):1746-54. Epub 2008 Jun 26.
• Schwaenen C, Viardot A, Berger H, Barth TF, Bentink S, Döhner H, Enz M, Feller AC, Hansmann ML, Hummel M, Kestler HA, Klapper W, Kreuz M, Lenze D, Loeffler M, Müller P, Müller-Hermelink HK, Ott G, Rosolowski M, Rosenwald A, Ruf S, Siebert R, Spang R, Stein H, Truemper L, Lichter P, Bentz M, Wessendorf S; Molecular Mechanisms in Malignant Lymphomas Network Project of the Deutsche Krebshilfe.

  Microarray-based genomic profiling reveals novel genomic aberrations in follicular lymphoma which associate with patient survival and gene expression status.

  Genes Chromosomes Cancer. 2009 Jan;48(1):39-54.
• Martin-Subero JI, Kreuz M, Bibikova M, Bentink S, Ammerpohl O, Wickham-Garcia E, Rosolowski M, Richter J, Lopez-Serra L, Ballestar E, Berger H, Agirre X, Bernd HW, Calvanese V, Cogliatti SB, Drexler HG, Fan JB, Fraga MF, Hansmann ML, Hummel M, Klapper W, Korn B, Kuppers R, Macleod RA, Moller P, Ott G, Pott C, Prosper F, Rosenwald A, Schwaenen C, Schubeler D, Seifert M, Sturzenhofecker B, Weber M, Wessendorf S, Loeffler M, Trumper L, Stein H, Spang R, Esteller M, Barker D, Hasenclever D, Siebert R.

  New insights into the biology and origin of mature aggressive B-cell lymphomas by combined epigenomic, genomic and transcriptional profiling.

  Blood. 2008 Dec 15. Epub ahead of