Biometrie und Bioinformatik von SNP-Array Daten aus Assoziationsstudien

Genomweite Scans mittels SNP (single nucleotide polymorphism)-Arrays in großen, unverwandten Kollektiven dienen der hypothesenfreien Suche nach Assoziationen zwischen genetischen Loci und phänotypischen Merkmalen. Die Arbeitsgruppe entwickelt eine Auswertungspipeline für diese Daten. Dies umfasst die Datenablage, -verwaltung, Qualitätskontrolle, Berechnung von Standardtests, Interpretation, Aufbereitung der Ergebnisse und die Auswahl von Kandidaten für Validierungsstudien. Die Arbeiten erfolgen in Zusammenarbeit mit der GSF in München.

Des weiteren werden Techniken zur Planung (Mehrstufendesigns, Poweranalyse, Matching) und weiterführende Analysetechniken (Kandidatengen-Analyse, Populationsstrukturierung, Inzucht-Analyse, Linkage Mapping) implementiert und verglichen.

Projektleiter

Mitarbeiter

• Dr. Markus Scholz
• Dr. Dirk Hasenclever
• PD Dr. Ernst Schuster
• Arnd Groß
• Karsten Krug
• Nab Raj Roshyara
• Prof. Dr. Markus Löffler