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INSTITUT FÜR MEDIZINISCHE INFORMATIK, STATISTIK UND EPIDEMIOLOGIE English Website

Biometrie 2 - Analyse von Genexpressionsdaten

Dozent: Dr. Dirk Hasenclever
Termin: Freitags 09:15 Uhr - 10:45 Uhr
OrtIMISE Raum 104
Übung dazu: nach Vereinbarung

Inhalt

  • Technologien der Messung von Genexpressionen
  • Statistischen Modelle des Messprozesses bei Affymetrix-Chips
    • Verfahren der Background-Elimination
    • Normalisierungsverfahren
    • Berücksichtigung der Mismatch Information
    • Verfahren der Signalsynthese
  • Selektion differentiell exprimierter Gene
    • Multiplizitätsproblem
    • Globale Kontrolle des Fehlers erster Art
    • Kontrolle der Rate der Falsch-Positiven
    • Methoden der Schätzung des Anteils differentieller Gene
  • Grundverfahren der multivariaten Statistik
  • Clusterverfahren: Clustern von Genen und Chips
  • Klassenprädiktionsverfahren
  • Praktischer Umgang mit Genchip-Daten mit Hilfe von R und den Routinen des Bioconductor-Projekts (Freeware) in der Übung
Letzte Änderung: 23.04.2015 Zeit: 0,057 s