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INSTITUT FÜR MEDIZINISCHE INFORMATIK, STATISTIK UND EPIDEMIOLOGIE English Website

Biometrie 2 - Analyse von Genexpressionsdaten

Informationen zur Vorlesung

Dozent
Termin Freitags, 09:15-10:45
Start 14.04.2006 (wegen Praktikum in 1. Woche)
Raum Härtelstr. 16-18, Seminarraum S110

Informationen zur Übung (1 SWS)

Dozent
Termin nach Vereinbarung (zum Teil als Block)

Inhalt der Vorlesung

  • Technologien der Messung von Genexpressionen
  • Statistischen Modelle des Messprozesses bei Affymetrix-Chips
    • Verfahren der Background-Elimination
    • Normalisierungsverfahren
    • Berücksichtigung der Mismatch Information
    • Verfahren der Signalsynthese
  • Selektion differentiell exprimierter Gene
    • Multiplizitätsproblem
    • Globale Kontrolle des Fehlers erster Art
    • Kontrolle der Rate der Falsch-Positiven
    • Methoden der Schätzung des Anteils differentieller Gene
  • Grundverfahren der multivariaten Statistik
  • Clusterverfahren: Clustern von Genen und Chips
  • Klassenprädiktionsverfahren
  • Praktischer Umgang mit Genchip-Daten mit Hilfe von R und den Routinen des Bioconductor-Projekts (Freeware)

Vorlesungsunterlagen

Die Vorlesungsunterlagen stehen als PDF-Dokumente im passwortgeschützen Bereich zum Download bereit.

Zusätzlich stehen die Skripte zum R-Kurs zum Download bereit.

Weitere Informationen

Letzte Änderung: 07.09.2016Redakteur: Zeit: 0,07 s