Statistische Analyse von High-throughput-Daten (10-202-2413)
Informationen zur Vorlesung
Dozent | |
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Termin | Montags, 09:15-10:45 |
Raum | Härtelstr. 16-18, Seminarraum 110 |
Informationen zur Übung
Dozent | |
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Termin | Donnerstags, 11:15-12:45 |
Raum | Härtelstr. 16-18, Seminarraum 110 |
Informationen zum Seminar "Statistische Analyse von RNA-Seq Daten"
Dozent | Prof. Dr. Korbinian Strimmer |
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Termin | Mittwochs, 13:30-15:00 |
Raum | Härtelstr. 16-18, Seminarraum 109 |
Inhalt der Vorlesung
- Technologien der Messung von Genexpressionen
- Statistischen Modelle des Messprozesses bei Affymetrix-Chips
- Verfahren der Background-Elimination
- Normalisierungsverfahren
- Berücksichtigung der Mismatch Information
- Verfahren der Signalsynthese
- Selektion differentiell exprimierter Gene
- Multiplizitätsproblem
- Globale Kontrolle des Fehlers erster Art
- Kontrolle der Rate der Falsch-Positiven
- Methoden der Schätzung des Anteils differentieller Gene
- Grundverfahren der multivariaten Statistik
- Clusterverfahren: Clustern von Genen und Chips
- Klassenprädiktionsverfahren
- Praktischer Umgang mit Genchip-Daten mit Hilfe von R und den Routinen des Bioconductor-Projekts (Freeware)
Vorlesungsunterlagen
Die Vorlesungsunterlagen des letzten Sommersemesters stehen als PDF-Dokumente im passwortgeschützen Bereich zum Download bereit.
Zusätzlich stehen die Skripte zum R-Kurs zum Download bereit.
Diese Dokumente werden im Verlauf des Semesters aktualisiert.