Statistische Aspekte der Analyse molekularbiologischer und genetischer Daten (09-202-2413)

Verwendbarkeit

• Wahlpflichtmodul im Master Bioinformatik
• Vertiefungsmodul im Master Informatik, Schwerpunkt Medizinische Informatik

Ziele

Nach erfolgreichem Abschluss des Moduls können die Teilnehmer grundlegende Konzepte und Prinzipien der Genetischen Statistik richtig anwenden. Sie verstehen Probleme molekularer Studienplanung, -durchführung, Datenanalyse und Interpretation. Die Teilnehmer kennen wichtige Software- und Datenbankressourcen zur Analyse und Interpretation genetischer Daten und können diese anwenden.

Die Teilnehmer haben sich darüber hinaus mit aktuellen Problemen im Bereich der Analyse molekularer Daten selbstständig auseinandergesetzt.

• Anwenden von Konzepten und Prinzipien der Genetischen Statistik
• Verstehen von grundlegenden Problemen der molekularen Studienplanung, Durchführung, Datenanalyse und Interpretation
• Anwenden wichtiger Software- und Datenbankressourcen
• Analysieren aktueller Probleme der Analyse molekularer Daten

Inhalte

• Biologische Grundlagen
• Statistische Konzepte in der Genetik
• Populationsgenetik
• Genetische Studiendesigns + Planung
• SNP (single nucleotide polymorphism)-Array Technologie, Prozessierung, Qualitätsanalyse, Analyse von Variationen der Kopienzahl (Copy-number variations)
• Genomweite Assoziationsstudien (GWAS) und weitergehende Analysen (z.B. X-Chromosom, Seltene Varianten, Scoring-Methoden, Imputation, Berücksichtigung von Populationsstrukturen, Metaanalysen, Interaktionsanalyse)
• Genomische Annotation
• Analysetools
• Online-Ressourcen
• Genexpressionsarray Technologie, Prozessierung, Qualitätsanalyse
• Genexpressionsassoziationsanalysen, Genset-Anreicherung
• Metabolische Daten (Prozessierung, Analysen)
• Quantitative Merkmalsanalysen (QTLs) mit Schwerpunkt auf Expressions- und Metabolom-QTLs
• Integrative Analysen, Modelle