Aufbereitung und Analyse von Daten in phänotypischen und genotypischen Forschungs­daten­banken mit tranSMART

Processing and Analyzing Data from Phenotype and Genotype Research Databases Using tranSMART

Die bessere Verfügbarmachung und langfristige Bereitstellung von Forschungsprimärdaten zum Zweck der reproduzierbaren Auswertung stellt eine wichtige Aufgabe für die Biomedizinische Informatik dar. Gerade in Projekten der vernetzten Forschung werden Daten oft aus unterschiedlichen Quellen, mit unterschiedlichen Prozessen und an unterschiedlichen Standorten erhoben, gereinigt, transformiert, zusammengeführt und ausgewertet. Aspekte „leichtgewichtiger“ Analysen, z.B. zur frühzeitigen Qualitäts­sicherung der Dokumentation, zur Fallzahlabschätzung, für retrospektive Beobachtungsstudien, zur Generierung neuer Forschungshypothesen oder zur Planung der Rekrutierung in folgenden Daten­erhebungen, können aus Ressourcengründen oftmals nur eingeschränkt unterstützt werden. Dieses Manko lässt sich durch den Einsatz der tranSMART-Plattform verringern, über die sich einfache bis mittelkomplexe mathematische Analysen mithilfe einer grafische Oberfläche ausführen lassen.

• Sebastian Stäubert