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INSTITUT FÜR MEDIZINISCHE INFORMATIK, STATISTIK UND EPIDEMIOLOGIE

Terminologie- und Ontologie-basierte Phänotypisierung (TOP)

Vorstellung

Arbeitsgebiete

  • Algorithmische Phänotypisierung
  • Ontologische Grundlagen der Phänotypisierung
  • Semantische Suche, Dokumenten-Klassifikation/-Clustering
  • Verwaltung medizinischer Terminologien
  • Ontologie-basierte Softwareentwicklung
  • Entwicklung von Domänen-Ontologien

Projekte

Neben dem Hauptprojekt 'Entwicklung eines Terminologie- und Ontologie-basierten Phänotypisierungs-Frameworks' ist die Nachwuchsgruppe an den folgenden MII-Projekten beteiligt:

INTERPOLAR

Im INTERPOLAR entwickeln Domänenexperten mit dem TOP Framework Modelle zur Erkennung von unerwünschten Ereignissen (z.B. medikamentenbedingten Gesundheitsrisiken oder unerwünschten Arzneimittelwechselwirkungen).

GeMTeX

Das GeMTeX Projekt wird ein umfangreiches anonymisiertes deutschsprachiges Textkorpus mit klinischen Texten zur Verfügung stellen. Unsere Aufgabe im Projekt ist es, einen halbautomatischen Workflow zur Klassifikation der Dokumente zu entwickeln. Auch hier soll das TOP Framework eingesetzt werden, in diesem Fall zur Modellierung von Search Ontologies, die eine semantische Suche unterstützen.

Lehre

  • Es finden regelmäßig Schulungen/Workshops zu den Forschungsthemen der Nachwuchsgruppe statt. Falls Sie Interesse an einer Schulung haben, nehmen Sie bitte Kontakt mit uns auf.
  • Die Nachwuchsgruppe führt eine Vorlesung und eine Übung zum Thema 'Ontologie-basierte Phänotypisierung' im Rahmen der Vorlesungsreihe 'Data Warehouses und Data Repositories für medizinische Versorgung und Forschung' durch.

Team

Von links nach rechts: Ralph Schäfermeier, Alexandr Uciteli, Franz Matthies, Christoph Beger
Von links nach rechts: Ralph Schäfermeier, Alexandr Uciteli, Franz Matthies, Christoph Beger
Fotograf: Swen Reichhold

Arbeitsgruppenleiter

Tel.: +49 341 97 16155
Fax: +49 341 97 16109
Postanschrift: Dr. Alexandr Uciteli
Universität Leipzig
Institut für Medizinische Informatik, Statistik und Epidemiologie
Härtelstraße 16-18
04107 Leipzig